Computer simulatie van enzym verbetert het begrip van hepatitis c


Computer simulatie van enzym verbetert het begrip van hepatitis c

Een team wetenschappers heeft een computersimulatie gemaakt van een enzym genaamd NS3, dat een belangrijke rol speelt bij het helpen van het repliceren van hepatitis C-virus en in het lichaam te verspreiden. De ontdekking moet de zoektocht naar drugs helpen die het virus uniek richten.

De afbeelding toont het enzym NS3 in actie bij het ontrafelen van virale RNA.

Beeldkrediet: SISSA

De wetenschappers, van de International School of Advanced Studies (SISSA) in Triëst, Italië, beschrijven hun werk in het tijdschrift Nucleïnezuren Onderzoek .

Naarmate wetenschappers beginnen meer te begrijpen hoe een bepaald virus repliceert, hoe beter de kans op het vinden van medicijnen die het virus verspreiden stoppen.

Het team besloot NS3 te analyseren omdat het specifiek is voor het hepatitis C virus. Zij merken op dat een geneesmiddel dat selectief het enzym selecteert, geen bijwerkingen zou veroorzaken in de rest van het lichaam.

Maar om NS3 te kunnen richten, moeten wetenschappers meer weten over hoe het zich gedraagt. Tot nu toe is de enige kennis uit snapshots - stilstaande beelden - van het enzym verkregen door middel van kristallografie studies.

De nieuwe computersimulatie biedt onderzoekers de eerste mogelijkheid om het gedrag van NS3 te observeren alsof ze een bewegende film kijkt.

NS3 is een helicase - een enzym dat interactie heeft met het virus 'RNA (virussen hebben geen DNA, hun genetische code wordt in RNA gehouden).

NS3 'kruipt langs het virale RNA als een rups'

NS3 helpt om het virale DNA voor replicatie te ontrafelen en voor te bereiden, een proces dat een tweede enzym met de naam polymerase omvat. Eerste auteur en SISSA-student Andrea Pérez-Villa legt uit:

"NS3 kruipt langs de RNA-streng, die zich uitstrekt als een rups en zo maakt het het deel van het virus los waaraan het polymerase dan hecht."

De computersimulatie van het team laat zien niet alleen hoe NS3 werkt met virale RNA, maar ook hoe het proces ATP gebruikt - de chemische eenheden van energie die eiwitten verbruiken als ze hun werk doen.

Senior auteur Giovanni Bussi, professor en hoofd van een SISSA-groep die computer-simulaties maakt om RNA te studeren, zegt dat hun model de "interactie met ATP en vervolgens met ADP, een afvalproduct, samen met fosfaat, weergeeft nadat ATP was gebruikt." Hij concludeert:

Door in detail te weten hoe dit helicase werkt, zouden we in de toekomst proberen de virale replicatie te blokkeren en zo de ziekte te voorkomen dat het zich in het lichaam vermeerdert."

De volgende reeks video's uit SISSA toont de computersimulatie van NS3 die interactie heeft met virale DNA.

Volgens de Wereldgezondheidsorganisatie (WHO) hebben 130-150 miljoen mensen wereldwijd chronische hepatitis C-infecties en ongeveer een half miljoen mensen sterven elk jaar aan een leverziekte die verband houdt met de infectie.

Ondertussen, Medical-Diag.com Onlangs gemeld hoe wetenschappers een groep leverregeneratiecellen hebben ontdekt die het beschadigde leverweefsel kunnen aanvullen zonder gevaarlijke tumoren te produceren.

A Tour of the Cell (Video Medische En Professionele 2018).

Sectie Kwesties Op De Geneeskunde: Ziekte