Een enkele test kan bijna elk virus detecteren


Een enkele test kan bijna elk virus detecteren

Een nieuwe test die vrijwel elk virus detecteert dat mensen en dieren besmet is, is ontwikkeld door onderzoekers aan de Universiteit van Washington van de Universiteit van Washington, St. Louis, volgens resultaten gepubliceerd in het tijdschrift Genoom Onderzoek .

De nieuwe test kan een breed scala van virussen detecteren, waaronder norovirus.

Veel duizenden virussen zijn bekend om ziekte te veroorzaken bij mensen en dieren, en het goed diagnosticeren hiervan kan een lang en kostbaar proces zijn, waarbij talrijke tests worden betrokken.

Virussen die voorkomen in en op het menselijk lichaam zijn collectief bekend als de viroom. Volgens de senior auteur van Dr. Gregory Storch, de professor van pediatrie Ruth L. Siteman, in een proces dat bekend staat als "enhanced virome sequencing", hebben onderzoekers een manier ontwikkeld om een ​​breed net te werpen en "virusse op te sporen die bij Zeer lage niveaus."

Nog geen test is gevoelig genoeg om lage niveaus van virale insecten te detecteren. Veel tests zijn beperkt tot het detecteren van alleen die virussen die worden vermoed dat ze verantwoordelijk zijn voor de ziekte van een patiënt.

De nieuwe test kan worden gebruikt om uitbraken van dodelijke virussen zoals Ebola, Marburg en ernstige acute respiratoire syndroom (SARS) te detecteren, evenals meer voorkomende virussen, waaronder rotavirus en norovirus, die beide ernstige gastro-intestinale infecties veroorzaken.

Het team verwacht dat de test nuttig kan zijn in gevallen waarin standaard tests geen diagnose onthullen, of wanneer het niet bekend is wat een uitbraak heeft veroorzaakt.

Test onthult virussen die niet worden gedetecteerd door standaard testen

De nieuwe test - genaamd ViroCap - is in patiëntmonsters getoond om virussen die niet worden gevonden door het standaard testen te detecteren.

De test sequences en detecteert virussen met dezelfde gevoeligheid als testen van polymerase kettingreactie (PCR), die veel gebruikt worden in klinische laboratoria en beschouwd worden als de "gouden standaard".

Hoewel PCR-tests op een keer voor ongeveer 20 soortgelijke virussen kunnen screenen, lijkt ViroCap theoretisch te testen op vrijwel elk virus.

Om de test te ontwikkelen, richtte onderzoekers unieke streken van DNA of RNA van elke bekende groep van virussen die mensen en dieren infecteren: 2 miljoen unieke strekken genetisch materiaal in totaal.

Deze strengen van materiaal worden gebruikt als probes om virussen uit te plukken in patiëntmonsters die een genetische wedstrijd zijn. Het gecompenseerde virale materiaal wordt dan geanalyseerd met behulp van high-throughput genetische sequencing.

Het team suggereert dat als er volledig nieuwe virussen worden ontdekt, hun genetische materiaal gemakkelijk aan de test kan worden toegevoegd.

Evaluatie toont aan dat ViroCap 52% ​​effectiever is

De onderzoekers hebben de nieuwe test geëvalueerd door twee sets biologische monsters te nemen - bijvoorbeeld van bloed, ontlasting en nasale afscheiding - van patiënten in het St. Louis Children's Hospital.

Standaard testen gedetecteerd virussen in 10 van de 14 patiënten, maar de nieuwe test vond virussen in de vier kinderen die eerder testen hadden gemist.

Gemeenschappelijke, dagelijkse virussen die niet door de standaardtest zijn gedetecteerd, bevatten influenza B, een oorzaak van seizoensgriep, parechovirus, een mild maagdarm- en ademhalingsvirus, herpesvirus-1, verantwoordelijk voor koude zweren in de mond en varicella-zostervirus, waardoor waterpokken.

In een tweede groep kinderen met onverklaarde koorts ontdekte standaard testen 8 van de 11 virussen, maar de nieuwe test vond nog eens zeven, waaronder een ademhalingsvirus genaamd humaan adenovirus B type 3A, die meestal onschadelijk is, maar kan bij sommige patiënten ernstige infecties veroorzaken.

In totaal is het aantal virussen die in de twee patiëntengroepen gedetecteerd zijn, gesprongen van 21 van 32 - een stijging van 52%.

De nieuwe test maakt het ook mogelijk om subtypes van virussen gemakkelijk te identificeren, omdat ze gedetailleerde genetische informatie bevatten over verschillende stammen van bepaalde virussen.

Bijvoorbeeld, terwijl standaard tests een virus als influenza A geïdentificeerd hebben, wat seizoensgebonden griep veroorzaakt, heeft de nieuwe test aangegeven dat het virus een bijzonder hard subtype was, genaamd H3N2.

Het laatste griepseizoen, H3N2 heeft bijgedragen aan ongeveer 36.000 doden in de VS. Deze informatie kan leiden tot een effectievere behandeling bij patiënten zoals jonge kinderen, oudere volwassenen en mensen met verzwakt immuunsysteem.

Studie auteur Todd Wylie zegt:

De test is zo gevoelig dat het ook variantstammen detecteert van virussen die genetisch nauw verwant zijn. Geringe genetische variaties tussen virussen kunnen vaak niet worden onderscheiden door huidig ​​beschikbare tests en compliceren artsen het vermogen om alle varianten met één test te detecteren."

De ontwikkelde technologie wordt publiekelijk ter beschikking gesteld aan wetenschappers en clinici wereldwijd ten behoeve van patiënten en onderzoek.

Verdere onderzoek is nog nodig om de nauwkeurigheid van de test te valideren, wat betekent dat het enkele jaren kan duren voordat het klinisch beschikbaar is, maar wetenschappers zullen de technologie kunnen gebruiken om virussen in een onderzoeksinstelling te studeren.

De auteurs hopen ook dat het kan worden aangepast om andere pathogenen te detecteren dan virussen, zoals bacteriën, schimmels en andere microben. Het kan ook genen aangaan die aangeeft dat een pathogeen resistent is tegen antibiotica of andere geneesmiddelen, volgens mede-auteur Kristine Wylie.

De nieuwe test zorgt voor een beter inzicht in dergelijke virussen en de rol die zij spelen om het lichaam gezond te houden.

Eerder dit jaar, Medical-Diag.com Gerapporteerd op een test genaamd VirScan dat onderzoekers zeggen kan een mens de hele virale geschiedenis detecteren door een enkele druppel bloed te scannen.

5 More Computer Viruses You Really Don't Want to Get (Video Medische En Professionele 2019).

Sectie Kwesties Op De Geneeskunde: Medische praktijk